研究报告

香蕉查尔酮合酶基因家族生物信息学分析  

胡会刚 , 胡玉林 , 庞振才 , 陈晶晶 , 段雅婕 , 李伟明 , 孙德权*
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 农业部热带果树生物学重点实验室, 湛江, 524091
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2018年04月19日    接受日期: 2019年02月07日    发表日期: 2019年01月21日
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摘要

查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成的关键酶,在类黄酮的合成过程中起重要的作用。为了探索 CHS 基因家族在调控黄酮类物质合成的功能,本研究对 20 个香蕉 CHS 基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:1 个香蕉 CHS 基因没有内含子,大多含有 2~3 个内含子;20 个香蕉 CHS 蛋白中有 6 个偏碱性,6 个显中性,8 个偏酸性;除 2 个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉 CHS 蛋白主要以 琢- 螺旋为主要构成元件;稳定指数分析发现 4 个 CHS 蛋白为稳定蛋白;脂溶指数分析表明 1 个香蕉 CHS 蛋白为疏水性蛋白;亚细胞定位分析表明大多数 CHS 蛋白定位于细胞基质,一个分布于细胞核;基序 1、基序 2、基序 3 是该家族的保守基序。

关键词
香蕉;查尔酮基因家族;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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